뉴욕의 하수구로 스며든 미스터리한 녹색 액체, ‘우즈’로 인해 
아기 거북이 네 마리와 청년 쥐 스플린터는 사람과 비슷한 모습의 돌연변이가 된다. 

15년 후, 10대 청소년이 된 레오나르도, 미켈란젤로, 라파엘, 도나텔로는
하수구에 숨어 사는 생활에서 벗어나 인간 세상에서 평범한 삶을 살고 싶